이를 통해 그가 자주국의 의지를 포기하지 않고 강대국과의 외교를 통해 나라를 지켜내려는 의지가 명확했다는 것을 알 수 있다.

의지라는 말이 두 번 들어감으로써 문장이 어색해졌나요?

같은 표현을 중복해 쓰는 것은 어색합니다. 처음 나오는 '의지'는 의미상 '노력'이나 '노선'으로 고치는 것이 적절합니다.