한 문장 안에 '~하는데', '~했는데'라는 비슷한 연결어미가 연속으로 세 번 사용되어 문장의 호흡이 어색하게 읽힙니다. 문장을 나누고 위의 표현을 다음처럼 다듬는 것이 좋습니다.

제자들은 대부분 예수님의 질문 의도를 파악하지 못했고, 그런 제자들에게 예수님은 다시 말씀을 이어가셨다. 예전에는 이 말씀의 의미가 명확하다고 생각했으나, 지금은 과연 내가 알고 있던 그 뜻이 맞는지 의심스럽다.