왕은 궁궐이 멀어서 못 오겠다면 가까이 있는 행재소로 오라고 초청이 아니라 명을 내린다.

‘초청이 아니라 명을 내린다.’로 쓰면 무난할까요?

'초청이 아닌 명을 내린다.'로 고치면 더 자연스럽습니다.