졸업한 지 2년 뒤, 서울고등법원 형사1부 법정의 피고인은 정태영이었다

졸업한 지 2년 뒤, 정태영은 서울고등법원 형사1부 법정의 피고인이 되어 있었다

졸업한 지 2년 뒤, 정태영은 서울고등법원 형사1부 법정의 피고인으로 서 있었다.

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마지막 문장의 흐름이 가장 자연스럽습니다.