그 회사에서는 월급으로 쌀 한 가마니를 계산해주었기 때문이다.

문장을 위와 같이 구성하면 맞나요?

'그 회사에서는 월급으로 쌀 한 가마니를 주었기 때문이다.'로 고치는 것이 더 명확한 표현입니다.